擬建的古洞站將位於未來古洞北新發展區的市中心，方便現有社區及新發展區的居民出行，亦有助釋放周邊地區的發展潛力。乘客未來將可在古洞站輕鬆轉乘東鐵綫及北環綫。

擬建的新田站將設於新田／落馬洲發展樞紐內的中央位置，為現有社區及發展樞紐內的居民提供更完善的交通基建網絡，提升當區與周邊地區的交通連接，有助推動新田成為宜居且暢達方便的住宅社區及就業樞紐。

擬建的牛潭尾站將設於《 牛潭尾土地用途檢討研究 》的研究範圍之內，以配合相關研究並滿足該區未來整體發展的交通需要。

擬建的凹頭站選址將配合地區整體的人口分佈及增長、現有及未來的土地規劃和房屋發展機遇，為現有及未來的社區提供更完善的交通基建網絡，提升區內與周邊地區的交通連接。

擬建的北環綫錦上路站將設於屯馬綫錦上路站旁，將為現有及未來社區，包括元朗錦田南公營房屋發展項目等提供更完善的交通基建網絡。未來錦上路站將升級為轉車站，連接北環綫及屯馬綫，方便附近居民來往各區，及使用東鐵綫的跨境鐵路服務過境。